Автономная Православная Церковь Японии, которая входит в состав Московского
Патриархата. Насчитывает около 36 000 человек. Каноническая территория — Япония.
Основанная русским миссионером архимандритом (затем архиепископом) Николаем
(Касаткиным) (1836—1912), который прибыл в Японию в 1861 году по решению
Священного синода Русской Православной Церкви. В 1870 году он основал и
возглавил Русскую православную миссию в Японии. Перевёл на японский язык
Священное Писание, богослужебные книги, построил в Токио Воскресенский собор. В
1970 году РПЦ предоставила Японской Православной Церкви автономию.
19 марта 1972 года новым предстоятелем был избран Феодосий (Нагасима).
В Японской Православной Церкви три епархии:
* Восточно-Японская (кафедра в Сэндай);
* Западно-Японская (кафедра в Киото);
* Токийская (кафедра в Токио).
В ЯПЦ один монастырь — мужской Святой Софии в префектуре Тиба.
С 2000 года предстоятелем Церкви — митрополит Даниил (Нусиро), митрополит
Токийский и всей Японии.
Резиденция и кафедральный храм — собор Воскресения Христова в Токио (при котором
находится единственная православная семинария). Собор широко известен как
Никорай-до (в честь Николая Касаткина).
В 2005 году в Токио, рядом с кафедральным собором Воскресения Христова
(Николай-до) по благословению митрополита Токийского и всей Японии Даниила был
образован первый монастырь Японской Автономной Православной Церкви. Настоятелем
монастыря, освященного в честь равноапостольного Николая Японского, стал
иеромонах Троице-Сергиевой лавры Герасим (Шевцов).
Входит в состав Церквей Вселенского православия.